塞爾達傳說的史詩般的故事：林克（Wind Waker）繼續進行，因為林克（Link）發現自己迷失了自己並在一次新冒險中獨自一人在不知名的海洋中。
具有直觀的觸摸屏控件和創新的難題，《塞爾達傳說：幻影沙漏》為該系列的粉絲提供了新的挑戰，並為《塞爾達傳奇》的新樂器介紹了易於掌握的介紹。但是時間越來越短，只有幻影沙漏才能購買他生存所需的幾分鐘。
- 手寫筆使控制鏈接比以往任何時候都更加容易。點擊屏幕以使鏈接移動，或掃除他周圍的手寫筆以擺動劍。玩家甚至可以為他的迴旋鏢繪製一條道路，並將其飛向難以到達的目標。
- 玩家可以將地圖存放在頂部屏幕上以快速參考，或將其放到觸摸屏上，以製作筆記，學習敵人，或為他們的船隻曼格（Gannos the Cannons）遵循船的路徑。
- 通過當地的無線連接與朋友競爭：通過特殊地牢指南鏈接以捕獲三角形，或者指揮反對他的力量。
遊戲故事情節：自從塞爾達傳說的事件發生以來，已經過去了幾個月：風狂，林克，特特拉和特特拉的海盜樂隊啟航尋找新土地。他們遇到了一片被密集的霧覆蓋的海洋，他們發現了一艘廢棄的船。當Tetra獨自探索這艘船時，她陷入危險，當他試圖營救她時，Link落入了海洋。當他在一個神秘的島嶼的海岸上昏迷時，他被仙女的聲音喚醒了。在這個童話的幫助下，他出發去尋找四人 - 回到他曾經知道的海洋。
人物：Link，Tetra和許多新角色本來是神秘的土地，Link發現自己被困。
如何在遊戲中進步：塞爾達傳說：幻影沙漏幾乎完全由手寫筆控制。使用觸摸屏，玩家直接鏈接的動作和攻擊：掃描運動觸發鏈接的旋轉攻擊和敲擊字符使鏈接與他們交談。手寫筆控件提供了一種更直觀的手段，可以打開拼圖解決的新可能性。
遊戲動作主要在觸摸屏上進行，頂部屏幕上有地圖。但是，玩家可以在觸摸屏上檢查地圖，並使用手寫筆進行筆記。這些地圖上的註釋在遊戲遊戲中保存在頂部屏幕上。玩家也使用地圖為他們的船隻圖表課程。玩家使用手寫筆在島上繪製一條路徑，設置了船隻的課程。然後，隨著船隻自動遵循繪製的路徑，玩家可以控制船隻的大砲來瞄準敵人。
在地牢中，玩家可以使用觸摸屏來繪製飛旋鏢的路徑，使他們在拐角處飛行或進入其他無法達到的區域。
特殊力量/武器/移動/特徵：手寫筆驅動的遊戲是《塞爾達傳說：幻影沙漏》的最引人注目的新功能。玩家使用手寫筆來控制鏈接，為船上的圖表課程，在地圖上標記筆記，並在Overworld和Dungeons中解決難題。
一個兩人的無線戰鬥模式將一個球員（作為鏈接）與另一個控制敵人追捕他的球員的鏈接。鏈接必須在敵人關閉之前收集足夠的力寶石。
